Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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