Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ccdc18Q640L5 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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