Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15342-201ENSMUST00000146222 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Hdlbp-201ENSMUST00000042498 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10390-201ENSMUST00000180812 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Foxn3-202ENSMUST00000085108 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a4-202ENSMUST00000116429 3755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37942-201ENSMUST00000191875 628 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r2b-201ENSMUST00000025377 2031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm5-201ENSMUST00000051137 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpla1-202ENSMUST00000114737 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpla1-201ENSMUST00000056866 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Clmn-202ENSMUST00000109937 3529 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfb1i1-204ENSMUST00000164710 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpu-201ENSMUST00000034045 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Dpysl3-202ENSMUST00000118043 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gbp8-202ENSMUST00000112718 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tango6-201ENSMUST00000048359 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37334-201ENSMUST00000192325 2938 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28361-201ENSMUST00000188825 474 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnab2-205ENSMUST00000159840 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms