Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms