Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpl28P41105 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpl28P41105 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms