Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RxraP28700 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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RxraP28700 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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RxraP28700 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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