Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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