Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms