Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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