Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pcsk9Q80W65 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms