Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Shank3Q4ACU6 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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