Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnph2-204ENSMUST00000113202 3988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 Lrtm2-202ENSMUST00000112756 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lrrc43Q3V0L5 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms