Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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