Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Sh3bp1P55194 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Sh3bp1P55194 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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