Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NcanP55066 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NcanP55066 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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NcanP55066 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NcanP55066 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NcanP55066 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NcanP55066 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NcanP55066 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NcanP55066 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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