Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VdrP48281 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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VdrP48281 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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