Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms