Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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