Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Gm2056J3QQ02 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Gm2056J3QQ02 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Gm2056J3QQ02 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Gm2056J3QQ02 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Gm2056J3QQ02 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2056J3QQ02 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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