Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms