Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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