Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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