Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim3Q99PE5 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms