Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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