Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccdc18Q640L5 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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