Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Traf3ip1Q149C2 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms