Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms