Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.3 ms