Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm20939L7N243 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Gm20939L7N243 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms