Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim39Q9ESN2 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim39Q9ESN2 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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