Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms