Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Top1mtQ8R4U6 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Top1mtQ8R4U6 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms