Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm9364-201ENSMUST00000199220 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm8054-201ENSMUST00000093411 483 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ddx47-201ENSMUST00000032326 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Lrp1b-207ENSMUST00000142688 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mill1-201ENSMUST00000066780 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nuf2-201ENSMUST00000028000 2068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Igkv4-58-201ENSMUST00000103355 292 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Tectb-201ENSMUST00000025936 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Scg2-202ENSMUST00000185234 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm15455-201ENSMUST00000117459 2557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Apol10b-201ENSMUST00000089465 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Cog4-202ENSMUST00000165867 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ywhae-201ENSMUST00000067664 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Tkt-201ENSMUST00000022529 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm22014-201ENSMUST00000158785 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Kcnk2-208ENSMUST00000194172 1200 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm19843-201ENSMUST00000198144 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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