Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Cldn17Q8BXA6 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn17Q8BXA6 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms