Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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