Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Acvr1-204ENSMUST00000112601 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Brinp3-205ENSMUST00000166814 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm44013-201ENSMUST00000204392 2262 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Numb-201ENSMUST00000021647 1815 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Nol11-201ENSMUST00000018577 3158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms