Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm28047Q3US59 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms