Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gca-201ENSMUST00000028257 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp82-203ENSMUST00000182546 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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