Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms