Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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