Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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