Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Hoxd9P28357 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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