Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms