Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Ccl20O89093 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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