Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms