Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Cldn23Q9D7D7 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Cldn23Q9D7D7 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Cldn23Q9D7D7 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Cldn23Q9D7D7 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Cldn23Q9D7D7 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Cldn23Q9D7D7 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn23Q9D7D7 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms