Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms