Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24269-201ENSMUST00000179216 77 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cysrt1-203ENSMUST00000186719 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC123944.1-201ENSMUST00000213414 160 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52l2-201ENSMUST00000000844 2950 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Pcnp-201ENSMUST00000096021 608 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14273-201ENSMUST00000136315 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Bgn-201ENSMUST00000033741 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nipal4-201ENSMUST00000020679 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ces1e-201ENSMUST00000034173 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nefm-201ENSMUST00000022638 3334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp655-202ENSMUST00000167316 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Lancl1-201ENSMUST00000027149 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Smok3c-201ENSMUST00000110967 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17743-201ENSMUST00000198545 1675 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cln3-202ENSMUST00000084589 3203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gatb-204ENSMUST00000127348 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Duxbl3-202ENSMUST00000112340 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Duxbl2-202ENSMUST00000172038 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd1b-202ENSMUST00000168527 8206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Trav5-4-201ENSMUST00000103664 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27813-201ENSMUST00000184343 354 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ncaph2-201ENSMUST00000036987 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cavin2-201ENSMUST00000051572 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20507-201ENSMUST00000163245 2860 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28048-201ENSMUST00000160826 2746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cd4-201ENSMUST00000024044 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms