Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms