Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp4P35123 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp4P35123 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Usp4P35123 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp4P35123 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp4P35123 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp4P35123 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp4P35123 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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